Gephi

Если есть набор данных см. Коллекция наборов сетевых данных, то этот набор может быть понять при помощи одного из макроскопов

Using Metadata to find Paul Revere https://kieranhealy.org/blog/archives/2013/06/09/using-metadata-to-find-paul-revere/ - Обзор использования сетевого анализа - сетевые метрики - для обнаружения ключевых игроков - в данном случае - Поль Ревир. Но, сделано в R

Литература:

• GEPHI – Introduction to Network Analysis and Visualization http://www.martingrandjean.ch/gephi-introduction/
  • Подробное описание - как и что делать с визуализацией
• Знакомимся с Gephi - biarmicus на Галактике
• Gephi как средство визуализации данных https://habrahabr.ru/post/136575/ Gephi является хоть и молодым, но очень мощным средством визуализации различных данных.
  • В связи и в сравнении с NetLogo
  • Описан формат импорта из баз данных, обязательные поля - похоже на VOSViewer
    • обязательные:
      • source — id начальной вершины
      • target — id конечной вершины
• Визуализация графа социальной сети - https://habrahabr.ru/post/164307/ сетевые метрики
• Граф отношений пользователей Google+ https://geektimes.ru/post/137022/
• Transforming 2-mode network data to 1-mode https://shawngraham.gitbooks.io/dh-workbook/content/docs/supporting%20materials/multimode-networks.txt.html
  • Описание работы с мультимодальным графом в Gephi - подробное описание
• Converting 2 mode networks with Multimodal plugin for Gephi https://electricarchaeology.ca/2012/04/04/converting-2-mode-with-multimodal-plugin-for-gephi/
  • Объединение Gephi и Sci2 - используется для фильтрации данных - удаляются несвязанные узлы - обмен через Pajek при этом
• http://www.northeastern.edu/nulab/gephi-tutorial/ - руководство по работе с биграфом Поля Ревира
• Tutorial: How to explore a network graph of electronic literature in Gephi http://jilltxt.net/?p=3730